故事讲述了大金刚,一只在军警的围捕下从帝国大厦摔下而且重伤的大猩猩。十年后,大金刚在乔治亚州亚特兰大的一所大学医疗研究中心获得了新生的机缘。研究人员开发了人工心脏,并筹备为大金刚进行心脏移植手术。然而,他们面临着一个挑战,需要找到与大金刚不异种类的血液。 在世人一筹莫展时,米奇意外地捕捉了另一只母猿并将其卖给了政府,以便为大金刚的手术供给需要的血液。艾咪,一位手术专家,负责执行此次手术。然而,手术后的大金刚与母猿逃回了它们的原生地,解脱了人类的节制。戎行随即包抄了这两只大猩猩,大金刚在炮击中再次受到严重危险。同时,母猿也在此次抨击袭击中被捕捉。为了营救母猿,大金刚将再次对人类睁开肆虐。