现在,浅川爱梨他们所在的是真正的贾巴沃克岛——未来机关的研究设施基地里,2-B班除了狛枝凪斗之外的全员都从【新世界程序】里苏醒了过来。
在他们集体接受治疗的时候，就见班主任雪染千纱眼睛红肿地守在一边,她的身边站着一脸担忧自责的御手洗亮太和造成他们失去记忆的罪魁祸首——【超高校级的神经学者】松田夜助。
由于刚从实验舱里出来，四周是嗡鸣的机械音，【新世界程序】里的记忆和重生前的记忆混杂在一起,浅川爱梨总有种“既然没有发生绝望事件为什么他们会在程序世界里自相残杀”的懵圈。
她努力地回忆着自己进入程序前的记忆，但仅仅能想到的只是修学旅行最后一天的晚上。
她提前上楼,前往四楼的小型电影院,将笔记本连在了投影仪上，以便大家一上楼就可以一起观看视频,然后因为吃得有些撑,在准备完一切后就跑了一趟厕所……
在厕所里，她看见了正在梳妆打扮的音无凉子，在和她打招呼的时候却突然失去了意识。
再睁开眼睛的时候,就是被篡改和抹去了记忆,强行带入了【新世界程序】里。
浅川爱梨是在厕所里失去了意识，但除了浅川爱梨以外的所有人都说浅川爱梨和他们一起看了视频。
她姗姗来迟后将灯关上,坐在了狛枝凪斗的身边。
大家是在看视频的过程中，感觉有奇怪的画面在脑海里闪过,然后失去了意识。
直到雪染千纱和御手洗亮太抱歉地叙事整个事情的经过,浅川爱梨才了解了他们进入【新世界程序】的真正原因。
未来机关是由希望之峰学院的毕业生们创立的一个组织。
会长天愿和夫和副会长宗方京助在贾巴沃克群岛上建立了多个研究设施，启动【新世界计划】是由于一部分参与暴动的预备学科的学生出现了严重的心理问题，所以在那次事件后,未来机关开始研究开发【新世界程序】，用于帮助陷入绝望的学生们和绝望残党们重获希望。
除此之外，就正如浅川爱梨在搜查中找到的未来机关的邮件——为了洗脑神座出流和江之岛盾子，让他们成为未来机关宝贵的战力。
但这个【新世界程序】却反过来被他们利用，被江之岛盾子植入黑白熊病毒后，篡改为了【绝望再生程序】。
而那天，所有人在观看视频后会集体失去意识，是因为【超高校级的动画师】御手洗亮太制作的视频能干涉到观看者的大脑。
通过色彩的变化刺激视觉中枢，通过诱导眼球的动向进行体验记忆的认知操作，通过声音来控制集中力，他所拥有的才能完全可以被称为洗脑技术的东西。
所以，江之岛盾子自第一眼遇到御手洗亮太后，就对他的动画师才能非常感兴趣。
之前绑架失败过了一次，而这次，她直接在他们制作的视频里动了手脚。
没有把御手洗亮太也带进【新世界程序】，是因为江之岛盾子的计划中需要他将他们自相残杀的画面制作成洗脑视频，用于向整个世界传播绝望。
而他们那晚看见的浅川爱梨是由才囚学院的白银紬cos扮演，她因为非常崇拜江之岛盾子而加入江之岛盾子为领袖的绝望集团。
虽然不是希望之峰学园的学生，却有着【超高校级的COSPLAYER】的才能，拥有一秒换装并能将任何虚拟人物完全再现的能力，即变装和变声，但因为COS的是现实世界中的人物，所以白银紬在假扮浅川爱梨的时候，全身皮肤过敏性发着红斑，被狛枝凪斗当场戳穿。
而将他们带进贾巴沃克岛的正是她假扮的雪染千纱。
雪染千纱是未来机关第五支部支部长，有权启动【新世界程序】。
与此同时，贾巴沃克岛也被绝望残党们成功占领。
浅川爱梨搜查时找到的那些关于【希望之峰学园史上最大最恶的绝望事件】和【人类史上最大最恶的绝望事件】的漫画书，其实是江之岛盾子用【超高校级的分析师】才能预测出来的未来。
这位【超高校级的绝望】预想中的【希望之峰学园史上最大最恶的绝望事件】会引发了外界的一系列暴力事件，从而爆发【人类史上最大最恶的绝望事件】，这就是【希望之峰学园史上最大最恶事件】对于江之岛盾子而言的意义。
但是，预备学科的暴动在浅川爱梨他们的干预下以失败告终，对初次享受到失败的绝望的江之岛盾子自身而言，这并不是终点，应该说她也预料到了失败的可能性，而开始